地方政府承擔(dān)著大量的政策再規(guī)劃和政策執(zhí)行職能，同樣需要智庫參與決策咨詢，以此提升政府的科學(xué)決策水平。同時(shí)，地方政府處理的主要是地方性、區(qū)域性的公共事務(wù)，由此決定智庫參與地方政府決策必然帶有自己的特殊性。
決策主體的多元化
地方公共決策的參與者包括政府、智庫、媒體、社會組織、利益集團(tuán)以及公民等行動主體，這些行動主體與中央政府決策層面的同類型主體相比有著自己的不同特點(diǎn)。在地方政府層面，公共決策參與的智庫主體以地方性智庫為主，例如地方社會科學(xué)院、地方高校或者研究中心等，尤其是地方的常規(guī)性與事務(wù)性決策，地方智庫參與的可能性更大。
但是，地方政府有時(shí)也會進(jìn)行一些具有地方特色的戰(zhàn)略性決策，或者因勢利導(dǎo)把地方性決策上升為國家層面決策，這時(shí)地方政府更傾向于向高級別智庫甚至國家級智庫尋求決策咨詢。之所以這樣做，可能是因?yàn)榈胤街菐觳痪邆湎嚓P(guān)決策所需要的專業(yè)知識與技能，但更有可能是因?yàn)榈胤秸Ｍ璐嗽诟蠓秶鷥?nèi)提升決策事項(xiàng)的影響力，尤其是該事項(xiàng)亟需上級政府財(cái)政或政策支持的時(shí)候。對于地方政府而言，這樣做也無可厚非，但若一味信奉“外來和尚好念經(jīng)”也會帶來一些問題。例如，高級別智庫雖具有一定戰(zhàn)略視野，但也存在對地方實(shí)際缺乏了解和對決策實(shí)踐感知不夠等問題。在這種情況下，高級別智庫對地方政府的決策咨詢就有可能失真，甚至?xí)碚`導(dǎo)。必須指出，有少數(shù)專家拋卻專業(yè)操守，為了自我私利，去迎合地方政府的“政績決策”需求，導(dǎo)致地方政府決策失誤不斷。近年來全國各地興起了開發(fā)園區(qū)建設(shè)熱潮，有的園區(qū)建設(shè)運(yùn)轉(zhuǎn)得很成功，但也有不少園區(qū)脫離地方經(jīng)濟(jì)發(fā)展實(shí)際，浪費(fèi)了大量公共資源卻留下了難以收拾的“爛攤子”，這其中不乏經(jīng)過知名智庫專家論證的“科學(xué)決策”。此外，高級別智庫決策咨詢下移，在一定程度上也擠占了地方智庫的發(fā)展空間，既不利于地方智庫的健康可持續(xù)發(fā)展，也不符合地方政府決策的長遠(yuǎn)利益。
決策事務(wù)的復(fù)雜化
黨的十六大第一次把我國政府職能歸結(jié)為經(jīng)濟(jì)調(diào)節(jié)、市場監(jiān)管、社會管理與公共服務(wù)四個(gè)方面，但具體到不同政府層級側(cè)重點(diǎn)并不相同，例如經(jīng)濟(jì)調(diào)節(jié)是中央政府的一項(xiàng)重要任務(wù)，但地方政府卻較少涉及此項(xiàng)職能。黨的十八屆三中全會則對中央與地方政府職能的界定作出了進(jìn)一步要求，明確提出要“加強(qiáng)中央政府宏觀調(diào)控職責(zé)和能力，加強(qiáng)地方政府公共服務(wù)、市場監(jiān)管、社會管理、環(huán)境保護(hù)等職責(zé)”，這為中央與地方政府事權(quán)界定提供了基本指導(dǎo)。
一般來說，中央政府負(fù)責(zé)提供全國性的公共物品，地方性公共物品則由地方政府負(fù)責(zé)提供；具有溢出效應(yīng)的交叉性公共物品或準(zhǔn)公共物品，可根據(jù)其具體特點(diǎn)決定是由中央政府提供，還是由中央與地方政府共同提供。中央與地方政府的職能劃分也大致勾勒出中央與地方政府決策事務(wù)的界限。通常而言，中央政府決策的主要事務(wù)更加強(qiáng)調(diào)全局性、戰(zhàn)略性，這對智庫宏觀層面的決策咨詢能力提出了更高要求，而地方政府則更關(guān)注區(qū)域性、事務(wù)性公共事務(wù)，智庫參與政府決策較多集中于中觀或微觀層面。此外，相比中央政府，地方政府需要應(yīng)對的公共事務(wù)更加具體，同時(shí)因其更加接近服務(wù)對象（有時(shí)直接面對基層群眾），政府決策需要回應(yīng)的公共問題更加繁多，需要協(xié)調(diào)的利益要求更加復(fù)雜，決策帶來的影響尤其是決策失誤帶來的負(fù)面影響會更加突出。近年來，我國群體性事件數(shù)量不斷攀升，成為影響社會穩(wěn)定與社會發(fā)展的突出問題，不可否認(rèn)，其中很大一部分是因?yàn)榈胤秸疀Q策不當(dāng)或決策失誤導(dǎo)致基層矛盾激化引發(fā)的。地方政府決策事務(wù)的特殊性對智庫的決策參與同樣提出了很高要求：它們不僅需要具備專業(yè)化的決策知識與技能，對決策事項(xiàng)進(jìn)行分析、反思與評判，還要積極深入地方治理實(shí)踐，認(rèn)真傾聽民眾呼聲，及時(shí)整合和回應(yīng)民眾訴求，并將其帶入到地方?jīng)Q策的具體議程中來。
決策環(huán)境的劣勢化
決策環(huán)境是智庫參與地方政府決策的重要外部條件。地方公共決策環(huán)境的劣勢化表現(xiàn)為：首先，資金支持力度不夠，政策研究投入嚴(yán)重不足；其次，決策體制機(jī)制不夠健全且缺乏必要的法制保障。在地方層面，官方或半官方智庫相對活躍，民間智庫因缺少政策與資金支持發(fā)展乏力，智庫作為政府“外腦”的職能難以真正體現(xiàn)。此外，由于缺乏明確的法律政策支持，智庫的法人主體地位不夠清晰，智庫的有效運(yùn)行難以得到法律保障。再次，在決策信息的收集與使用層面，地方政府在基礎(chǔ)數(shù)據(jù)與信息收集上投入嚴(yán)重不足，給相關(guān)理論研究與實(shí)踐開展帶來極大不便，加之一些地方政府開放性不夠（往往以涉及機(jī)密為由拒絕公開相關(guān)信息），限制了已有信息資源的共享利用。